Заслуженный деятель науки РФ, д.м.н., профессор С.И. Рапопорт награжден  памятной медалью им. А.Л. Чижевского за участие в организации и становлении Проблемной Комиссии по Хронобиологии и Хрономедицине РАМН, за многолетнюю работу в качестве заместителя председателя Проблемной Комиссии и разработку проблем гелиобиологии.